MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 7813

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022760	TCA	2	6	740868	740873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_022760	CAC	2	6	740881	740886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_022760	TC	3	6	740895	740900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_022760	CAT	2	6	740983	740988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_022760	TCA	2	6	741015	741020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_022760	CCA	2	6	741084	741089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_022760	CCA	3	9	741135	741143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_022760	CCT	2	6	741292	741297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_022760	CTTCT	2	10	741335	741344	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5010	NC_022760	GGC	2	6	741348	741353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_022760	GCT	2	6	741366	741371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_022760	TGT	2	6	741381	741386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_022760	GCA	2	6	741390	741395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_022760	TGAG	2	8	741473	741480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_022760	GCA	2	6	741521	741526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_022760	ATC	2	6	741611	741616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_022760	GCA	2	6	741658	741663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_022760	AT	3	6	741667	741672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_022760	ATG	2	6	741807	741812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_022760	A	7	7	741892	741898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_022760	GAA	2	6	741977	741982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_022760	ACC	2	6	741999	742004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_022760	CAA	2	6	742006	742011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_022760	CCAA	2	8	742019	742026	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_022760	CTG	2	6	742033	742038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_022760	AAG	2	6	742049	742054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_022760	AAT	2	6	742148	742153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_022760	CTC	2	6	742162	742167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_022760	ACC	2	6	742239	742244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_022760	CTT	2	6	742403	742408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_022760	TGT	2	6	742444	742449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_022760	A	6	6	742535	742540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_022760	ATT	2	6	742548	742553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_022760	AAT	2	6	742585	742590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_022760	GGT	2	6	742600	742605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_022760	TTC	2	6	742631	742636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_022760	ATT	2	6	742685	742690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_022760	ATT	2	6	742703	742708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_022760	TCTT	2	8	742713	742720	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_022760	TTG	2	6	742722	742727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_022760	GTA	2	6	742730	742735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_022760	TA	3	6	742734	742739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_022760	TAC	2	6	742789	742794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_022760	ATGTAC	2	12	742833	742844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5045	NC_022760	CTT	2	6	742847	742852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_022760	TAT	2	6	742948	742953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_022760	AT	3	6	742965	742970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_022760	T	7	7	742990	742996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_022760	GA	3	6	743052	743057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_022760	CCT	2	6	743065	743070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_022760	GAA	2	6	743074	743079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_022760	ACT	2	6	743087	743092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_022760	TAA	2	6	743131	743136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_022760	GCG	2	6	743166	743171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_022760	CGT	2	6	743179	743184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_022760	CTG	2	6	743191	743196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_022760	AAT	2	6	743206	743211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_022760	TCG	2	6	743245	743250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_022760	TGT	2	6	743251	743256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_022760	TCC	2	6	743334	743339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_022760	CAT	2	6	743419	743424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_022760	ACC	2	6	743444	743449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_022760	TGC	2	6	743454	743459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_022760	CTC	2	6	743526	743531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_022760	TCTT	2	8	743559	743566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_022760	TGG	2	6	743597	743602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_022760	CAT	2	6	743626	743631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_022760	CCT	2	6	743788	743793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_022760	GTA	2	6	743825	743830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_022760	GCC	2	6	743843	743848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_022760	AT	3	6	743866	743871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_022760	TCCTTG	2	12	743898	743909	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_022760	TAG	2	6	743928	743933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_022760	GAA	2	6	743999	744004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_022760	ACA	2	6	744024	744029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_022760	TCC	2	6	744168	744173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_022760	GGT	2	6	744231	744236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_022760	GCT	3	9	744263	744271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_022760	CAC	2	6	744301	744306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_022760	GGA	2	6	744377	744382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_022760	CAG	2	6	744384	744389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_022760	CT	3	6	744476	744481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_022760	AGA	2	6	744507	744512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_022760	CTG	2	6	744529	744534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_022760	CGC	2	6	744535	744540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_022760	CAT	2	6	747611	747616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_022760	AAG	2	6	747780	747785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_022760	GCA	2	6	747837	747842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_022760	CATG	2	8	747920	747927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_022760	GTC	2	6	747935	747940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_022760	CGC	2	6	747998	748003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_022760	TGT	2	6	748049	748054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_022760	AC	4	8	748238	748245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_022760	CAT	2	6	748266	748271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_022760	ACA	2	6	748288	748293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_022760	CAGT	2	8	748355	748362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_022760	C	6	6	748380	748385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5100	NC_022760	CAT	2	6	748410	748415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_022760	C	6	6	748497	748502	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5102	NC_022760	GGC	2	6	748506	748511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_022760	GA	3	6	748528	748533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_022760	CTT	2	6	748722	748727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_022760	C	6	6	748759	748764	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5106	NC_022760	AGT	2	6	748767	748772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_022760	CCA	3	9	748795	748803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5108	NC_022760	TTC	2	6	748822	748827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_022760	AAC	2	6	748922	748927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_022760	TTG	2	6	748942	748947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_022760	ACTT	2	8	749078	749085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_022760	CAT	2	6	749141	749146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_022760	TGT	2	6	749201	749206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_022760	ATGC	2	8	749241	749248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_022760	T	6	6	749287	749292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_022760	AC	3	6	749460	749465	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_022760	GCT	2	6	749577	749582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_022760	GT	3	6	749680	749685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_022760	TCCT	2	8	749730	749737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_022760	TGG	2	6	749855	749860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_022760	CCAA	2	8	749862	749869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_022760	GCA	2	6	749956	749961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_022760	CT	3	6	750013	750018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_022760	TCC	2	6	750019	750024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_022760	TCA	2	6	750034	750039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_022760	CA	3	6	750073	750078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_022760	TAT	2	6	750178	750183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_022760	CCCT	2	8	750210	750217	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5129	NC_022760	TACA	2	8	753770	753777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_022760	CCT	2	6	753823	753828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_022760	GTTGG	2	10	753829	753838	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_022760	CTGA	2	8	755329	755336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_022760	GCA	2	6	755448	755453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5135	NC_022760	GT	3	6	756504	756509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_022760	TC	3	6	764830	764835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5269	NC_022760	T	6	6	764970	764975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5409	NC_022760	ACT	2	6	788551	788556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5410	NC_022760	TGG	2	6	788634	788639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5411	NC_022760	CGT	2	6	788670	788675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5412	NC_022760	ACA	2	6	788735	788740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5413	NC_022760	GC	3	6	788764	788769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5414	NC_022760	ACA	2	6	788790	788795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5415	NC_022760	CACT	2	8	788835	788842	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5416	NC_022760	GATC	2	8	788844	788851	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5418	NC_022760	CTG	2	6	789011	789016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5422	NC_022760	CA	3	6	789144	789149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5424	NC_022760	AAC	2	6	789189	789194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5425	NC_022760	CCG	2	6	789203	789208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5431	NC_022760	CAA	2	6	789529	789534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5442	NC_022760	TCG	2	6	792903	792908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5448	NC_022760	AAT	2	6	795395	795400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5450	NC_022760	CGG	2	6	795431	795436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5451	NC_022760	CTA	2	6	795443	795448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5454	NC_022760	T	6	6	795616	795621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5472	NC_022760	TCCT	2	8	809749	809756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5489	NC_022760	TCC	2	6	811379	811384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5490	NC_022760	CTC	2	6	811396	811401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5492	NC_022760	AGAGG	2	10	811607	811616	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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